Référence

2025-14771  

Date de début de diffusion

18/04/2025

Date de parution

19/04/2025

Description du poste

Métier

Autres domaines Ingénierie de la recherche - Technicien supérieur de recherche

Intitulé du poste

ALTERNANCE - Ingénieur bioinformatique données génomiques microbiennes H/F

En français : titre du projet de recherche (si CDD scientifique)/sujet de stage/sujet d'apprentissage/objet de l'accueil)

Analyse en vue de valorisation bioinformatique de collections microbiennes

Missions/Activités

🔬L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.
Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur.

Scientifique ou non, vous souhaitez rejoindre une entreprise qui prône la diversité, internationale, guidée par la curiosité, et qui place l'humain au cœur de son projet stratégique ? Alors postulez à nos offres !

🎯 Missions :
Appliquer des outils bio-informatiques, en fournissant une caractérisation et des interprétations de haute qualité des données génomiques microbiennes.

· Effectuer des analyses de taxonomie génomique et préparer les rapports correspondants avec des fonctionnalités de visualisation des données

· Évaluer et interpréter des données HTS complètes provenant de génomes microbiens entiers afin de contribuer à l'attribution d'une taxonomie précise, et à la génomique comparative

· déposer les données génomiques dans des dépôts publics internationaux

· développer et appliquer des procédures d'intégration et de conservation des données

· participer à la préparation de graphiques, de tableaux et de figures pour la documentation de la validation des logiciels et les présentations

· participer aux projets de recherche internes et collaboratifs du CRBIP

· appliquer des workflows dans le contexte du contrôle de la qualité des données relatives à la séquence du génome entier (WGS) des souches microbiennes

Profil

✅ Profil :
Master 2 en bio-informatique
· Expérience avec des outils bio-informatiques de routine
· Connaissances en analyse de séquences génomiques
· Expérience en scripting et programmation
· Compétences transversales : autonomie, rigueur, esprit d'analyse.

Les compétences suivantes seront appréciées :
· Expérience des scripts Shell Linux (Bash)
· Connaissances des dépôts de données génomiques nationaux et internationaux
· Expérience dans la reconstruction phylogénétique

📑Vos conditions et environnement de travail :
• Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport
• Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias
• Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives sur le campus
• Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées
• Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus)
• Univers multigénérationnel et qui favorise l'égalité des genres
• Une communauté active d'alternants qui se réunit régulièrement
• Et… un réseau d'alumni pour l'après (ainsi qu'une belle ligne sur le CV !)

Compétences acquises à l'issue de votre stage/période d'apprentissage

Pipelines bio-informatiques nouveaux

.

Critères candidat

Niveau d'étude souhaité

Bac + 5

Certification ou habilitation requise

Aucune

Localisation du poste

Localisation du poste

France, Paris

Lieu

Demandeur

Poste à pourvoir le

01/09/2025